顯微鏡攝像頭與數碼相機都可以連接生物顯微鏡、熒光顯微鏡、偏光顯微鏡、金相顯微鏡、體視顯微鏡、測量工具顯微鏡等各種功能顯微鏡配套使用，也就是現在稱之為數碼顯微鏡與電腦型顯微鏡。但是，這兩者之前有什么不同呢？
1. 數碼相機無法實現實時預覽功能。在特殊照明條件下，如熒光，暗場條件下難以保證成像質量。
2. 數碼相機有自動曝光功能，在不同光源的情況下拍出來的圖像都不一樣，很難定性，如要測量圖像的面積、光密度等，非要專業攝像頭莫屬。
3.在ELISPOT Reader System、凝膠成像等儀器上如果用數碼相機的話會導致電子丟失、損耗等，使得不能完全捕捉到信號，對結果的分析不是很準確！
較后，向大家推薦幾款可連接顯微鏡使用的顯微鏡攝像頭及數碼相機：
數碼相機： 佳能與尼康、奧林巴斯各種單反相機 等等
顯微鏡攝像頭：YH-90(900萬顯微攝像頭)、YH-50（300萬顯微攝像頭）、 高靈敏度ＣＣＤ攝像頭、等等
